③人工合成的寡聚核苷酸引物需经PAGE或离子交换HPLC进行纯化。
④引物浓度不宜偏高,浓度过高有两个弊端:一是容易形成引物二聚体(primer-dimer),二是当扩增微量靶序列并且起始材料又比较粗时,容易产生非特异性产物。一般说来,用低浓度引物不仅经济,而且反应特异性也较好。一般用0.25-0.5pmoL/μL较好。
(3)Mg2+浓度:PCR反应体系中Mg2+浓度对扩增结果影响较大,通常是1.5-4mmoL/L,必要时可调整Mg2+浓度。
(4)dNTP浓度:1.25mmol/L,dNTP浓度过高,反应的特异性下降。
(5)反应条件:PCR反应条件中最重要的是退火温度,退火温度低,引物容易结合到模板的靶DNA序列,但反应的特异性下降;反之,特异性增加,但扩增效果不佳。一些生物技术公司在合成引物时注明了Tm值,以此为依据,退火温度比Tm值低3-5℃比较适宜。当然,在实际操作时可设置梯度以确定最佳退火温度。
[实验目的]
了解聚合酶链反应(PCR)的基本原理及其影响因素,掌握PCR的基本操作过程。
[仪器]
PCR仪、台式离心机、电泳仪、电泳槽、紫外检测仪
[试剂]
1、引物:用去离子水配成10 μmol /μL。
2、Taq聚合酶
3、10×PCR反应缓冲液(加镁离子)
4、dNTPs:四种核苷酸混合物,浓度为10mM
5、模板:含有R基因片段的重组cDNA的质粒
6、1%琼脂糖凝胶
7、50 ×TAE电泳缓冲液(1000 mL)
Tris 242 g,Na2EDTA.2H2O 37.2 g, 溶于600 ml 去离子水中;加冰乙酸57.1 ml, 最后用去离子水定容至1000 mL。
8、6× 上样缓冲液
0.25% 溴酚蓝;0.25%二甲苯睛蓝,30%甘油,溶于水中,4℃保存。
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