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Watson和Crick的DNA双螺旋模型有以下特点:
(1) DNA分子由两条反向平行的多核苷酸链组成,形成右手双螺旋,即从一端看过去,是以顺时针方向旋转。
(2) 双螺旋的直径是2nm;螺距为3.4nm,上下相邻碱基的垂直距离为0.34nm,交角为36°,每个螺旋有10个碱基对。
(3) 两条链反向平行,即两条链的5’和3’的方向相反;
(4) 糖一磷酸键是在双螺旋的外铡,两条链上的碱基通过氢键形成碱基对,使两条链连在一起,碱基对的平面与轴线垂直。
(5) 糖与附着在糖上的碱基近于垂直。
(6) 碱基配对时,必须一个是嘌呤,另一个是嘧啶。
(7) DNA双螺旋有大沟(major or wide groove)和小沟(minor or narrow groove)的存在。
模型中的碱基配对十分重要:①A-T和G-C配对时可形成很好的线性氢键;②A-T对和G-C对的几何形状一样,使双链中两侧去氧核糖的C1-C2之间的距离相近,故不会使双螺旋丧失对称性和产生畸形;③碱基对处在同一平面内。在平面内有对称轴,垂直于平面。碱基对围绕对称轴旋180°仍保持原来的对称性。这就是说在一个螺旋中虽碱基对在平面上的投影位置各不相同,但每对都可保持在一个平面内。那么不论核苷酸的顺序如何,都不会影响双螺旋的结构。因此不同碱基组成的DNA双螺旋,其外形都是光滑均匀的圆柱体;④为DNA半保留复制奠定了基础。
DNA分子上有大小沟之分,这是由于碱基和核糖的连接的糖苷键同在一侧,而不是呈旋转对称,分居两侧。碱基对的糖苷键将平面分割成两个扇形区域,一大于180°是大沟,一个小于180°是小沟。大沟常是多种DNA结合蛋白所处的空间。
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