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1、 RNA提取缓冲液(CTAB):2% CTAB(W/V),2% 聚乙烯吡咯烷酮PVP(W/V),100 mM Tris-HCl(pH8.0,DEPC处理的水配置),25mM EDTA, 0.5g/L 亚精胺Spermidine,2.0M NaCl,2%巯基乙醇(V/V,使用前加入)。由于在高温灭菌条件下,Tris-HCl要和DEPC发生反应,所以配RNA提取缓冲液时直接用DEPC 处理的水配制即可。
2、 SSTE:1 M NaCl,0.5% SDS(W/V),10 mM Tris-HCl pH8.0,1.0 mM EDTA 10M LiCl 直接用蒸馏水配10M LiCl,加1‰的DEPC过夜后,高温灭菌。; B9 Q# q& ~0 l* ^0 i
3、 3M NaAc
4、 氯仿:异戊醇(24:1)
5、 酚(pH4.5):氯仿:异戊醇(25:24:1)3 G2 w# O+ e% Q. S( \: A
6、 DEPC处理水 用1‰的DEPC处理蒸馏水过夜,高温灭菌% X9 M! g! c1 @+ u, l
7、 无水乙醇" b* ]' m* ]. J- K
8、 70%酒精
试验步骤:
1、 实验开始前将RNA提取液于65℃水浴锅中预热,离心管中加入ME(巯基乙醇)(10mL加80ul,50mL中加入300ul)。
2、 取约0.8g菌丝体(液体培养获得的菌丝用真空抽滤即可!固体培养就更好说了),在液氮中迅速磨成精细粉末,装入50 mL离心管,按1g材料8mL的量加入预热的RNA提取液,颠倒混匀。
3、 65℃水浴3-10 min,期间混匀2-3次。
4、 加入等体积的酚(注意是酸酚pH4.5):氯仿:异戊醇(25:24:1)抽提(10,000 rpm,4℃,5 min)。 j9 U7 j% F. a* l
5、 取上清,等体积的氯仿:异戊醇(24:1)抽提(10,000 rpm,4℃,5 min). `( F( y6 n2 A; K; n5 s" W) m
6. 加入1/4V体积10M LiCl溶液,4℃放置6hr以上(或过夜)。
6、 10,000 rpm,4℃离心20 min。
7、 弃上清,用500 ulSSTE溶解沉淀。4 X; [- b/ \1 [" e0 S% n
8、 酚:氯仿:异戊醇(25:24:1)抽提两次, 氯仿:异戊醇(24:1)抽提1次(10,000 rpm,4℃,5 min)。
9、 加2V体积的无水乙醇,在-70℃冰箱沉淀30 min以上。& l$ Q- p+ x4 c9 m
10、 12,000 rpm,4℃离心20 min。
11、 弃上清。沉淀用70%酒精漂洗一次,干燥。7 ]' W# y U& Z% d; Y4 ^6 x
12、 加200 ul的DEPC处理水溶解。
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