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真菌菌丝的总RNA的提取
文章来源: 文章作者: 发布时间:2007-11-07   字体: [ ]  
 

1、 RNA提取缓冲液(CTAB):2% CTAB(W/V),2% 聚乙烯吡咯烷酮PVP(W/V),100 mM Tris-HCl(pH8.0,DEPC处理的水配置),25mM EDTA, 0.5g/L 亚精胺Spermidine,2.0M NaCl,2%巯基乙醇(V/V,使用前加入)。由于在高温灭菌条件下,Tris-HCl要和DEPC发生反应,所以配RNA提取缓冲液时直接用DEPC 处理的水配制即可。

2、 SSTE:1 M NaCl,0.5% SDS(W/V),10 mM Tris-HCl pH8.0,1.0 mM EDTA  10M LiCl 直接用蒸馏水配10M LiCl,加1‰的DEPC过夜后,高温灭菌。; B9 Q# q& ~0 l* ^0 i

3、 3M NaAc

4、 氯仿:异戊醇(24:1)

5、 酚(pH4.5):氯仿:异戊醇(25:24:1)3 G2 w# O+ e% Q. S( \: A

6、 DEPC处理水 用1‰的DEPC处理蒸馏水过夜,高温灭菌% X9 M! g! c1 @+ u, l

7、 无水乙醇" b* ]' m* ]. J- K

8、 70%酒精

试验步骤:

1、 实验开始前将RNA提取液于65℃水浴锅中预热,离心管中加入ME(巯基乙醇)(10mL加80ul,50mL中加入300ul)。

2、 取约0.8g菌丝体(液体培养获得的菌丝用真空抽滤即可!固体培养就更好说了),在液氮中迅速磨成精细粉末,装入50 mL离心管,按1g材料8mL的量加入预热的RNA提取液,颠倒混匀。

3、 65℃水浴3-10 min,期间混匀2-3次。

4、 加入等体积的酚(注意是酸酚pH4.5):氯仿:异戊醇(25:24:1)抽提(10,000 rpm,4℃,5 min)。  j9 U7 j% F. a* l

5、 取上清,等体积的氯仿:异戊醇(24:1)抽提(10,000 rpm,4℃,5 min). `( F( y6 n2 A; K; n5 s" W) m

6. 加入1/4V体积10M LiCl溶液,4℃放置6hr以上(或过夜)。

6、 10,000 rpm,4℃离心20 min。

7、 弃上清,用500 ulSSTE溶解沉淀。4 X; [- b/ \1 [" e0 S% n

8、 酚:氯仿:异戊醇(25:24:1)抽提两次, 氯仿:异戊醇(24:1)抽提1次(10,000 rpm,4℃,5 min)。

9、 加2V体积的无水乙醇,在-70℃冰箱沉淀30 min以上。& l$ Q- p+ x4 c9 m

10、 12,000 rpm,4℃离心20 min。

11、 弃上清。沉淀用70%酒精漂洗一次,干燥。7 ]' W# y  U& Z% d; Y4 ^6 x

12、 加200 ul的DEPC处理水溶解。



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