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第八章 多序列比对的实际应用
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日期:2007-10-22 05:49:59
点击:132 评论:0
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| 多序列比对的实际应用 Andreas D.Baxevanis Genome Technology Branch National Human Genome Research Institude National Institutes of Health Bethesda.Maryland 在寻找基因和致力于发现新蛋白的努力中,人们习惯于把新的序列同已知功能的蛋白序列作比对。由于这些 |
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基因组序列比对软件—Mummer介绍
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日期:2007-10-22 05:48:19
点击:169 评论:0
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| MUMmer是一个快速比对两个基因组序列的软件。在一个普通的linux机器上,比对两个3~4Mb的基因组所需要的时间只要30秒不到。其余还有很多功能将在下面详细说明。 MUMmer的主页为 http://www.tigr.org/software/mummer/ ,只要填写好一个licenes,就可以免费下载该软件。 |
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序列比对软件及blast
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日期:2007-10-22 05:37:59
点击:1091 评论:0
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| 比对算法的种类 全局比对 寻找在全长范围内寻找最佳比对。 Needleman-Wunsch algorithm 局部比对 寻找局部区域的最高比对打分,这决定了局部比对的实际应用更加广泛。 Smith-Waterman algorithm 软件blast,fasta等 Blast概述 Blast,全称Basic Local Alignment Search |
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生物信息学
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日期:2007-06-24 11:00:33
点击:2277 评论:0
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| 撰稿人:黄英武 (解放军306医院) 过涛(清华大学生物信息学研究所) 审稿人:孙之荣(清华大学生物信息学研究所) 1 概述 2 生物信息数据库与查询 2.1 基因和基因组数据库 2.2 蛋白质数据库 2.3 功能数据库 2.4 其它数据库资源 3 序列比对和数据库搜索 3.1 序列两两 |
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生物信息学所用的方法和技术
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日期:2007-03-26 07:48:27
点击:220 评论:0
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| 在生物信息学研究中,常用的方法和技术如下。 一、数学统计方法 数学统计在生物信息学中是一种最常用的方法。例如,在分析DNA语言中的语义、分析密码子使用频率、利用马尔科夫模型进行基因识别时都要用到数学统计方法。 二、动态规划方法 动态规划(Dynamic Programming |
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分子生物学软件
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日期:2007-03-02 08:51:16
点击:323 评论:0
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| 目前,有很多软件可以解决分子生物学研究人员从立项到最后写论文的实际问题。但由于软件的数目太多,而且各个软件开发环境、运行平台和操作方法都各不相同——即使功能的某些方面是相似的,这就给使用者造成了许多的不便。 一、实验准备阶段 这时一般要查一些与实验相关 |
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生物信息学所用的方法和技术
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日期:2007-02-28 09:51:22
点击:161 评论:0
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| 在生物信息学研究中,常用的方法和技术如下。 一、数学统计方法 数学统计在生物信息学中是一种最常用的方法。例如,在分析DNA语言中的语义、分析密码子使用频率、利用马尔科夫模型进行基因识别时都要用到数学统计方法。 二、动态规划方法 动态规划(Dynamic Programming |
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生物化学分子生物学软件下载区-核酸低级结构分析
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日期:2007-02-20 12:09:51
点击:528 评论:0
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| AnnHyb 软件名称: AnnHyb 版主评级: ★★★ 作者: 操作系统: WIN 软件版本: 2.22 软件大小: 207k 版本时间: 1999.8.11 软件功能: AnnHyb2.22是设计PCR引物和DNA探针的辅助软件。主要功能有: 1.对寡核苷酸序列,计算溶解温度(nearest-neighbour algorithm,可 |
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生物化学分子生物学软件下载区-生物化工
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日期:2007-02-20 12:08:12
点击:178 评论:0
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| BioReactor Design 软件名称: BioReactor Design 版主评级: ★★ 作者: 操作系统: WIN 软件版本: 1.0 软件大小: 69k 软件功能: 生物反应器(发酵罐)设计软件,269k,鼠标指向哪里,哪里就有提示,主要是设计发酵罐的大小,搅拌器的位置、大小,液体流速密度、气 |
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生物化学分子生物学软件下载区-分子遗传
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日期:2007-02-20 11:53:42
点击:291 评论:0
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| DnaSP(DNA Sequence Polymorphism) 软件名称: DNA Sequence Polymorphism 版主评级: ★★★ 作者: 操作系统: WIN 软件版本: 3.14 软件大小: 4.5M 版本时间: 1999.5.20 软件功能: DnaSP(DNA Sequence Polymorphism,1999.5.20最新版)是一个对排列过的DNA多序列 |
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分子生物学软件
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日期:2007-02-03 11:11:00
点击:124 评论:0
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| 目前,有很多软件可以解决分子生物学研究人员从立项到最后写论文的实际问题。但由于软件的数目太多,而且各个软件开发环境、运行平台和操作方法都各不相同——即使功能的某些方面是相似的,这就给使用者造成了许多的不便。 一、实验准备阶段 这时一般要查一些与实验相关 |
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生物软件网
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日期:2007-01-27 21:57:30
点击:260 评论:0
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| 【URL】 http://www.bio-soft.net/ 生物软件网 【简介】 这是一个由华北制药集团新药中心:谈杰建立和维护生物软件导航站点,其中包括生物化学、生物化工的一些软件。 生物软件网 总 目 录 站内检索 生物软件光盘 原版书代购 国外软件代购 生物图书邮购 三维分子 DNA分 |
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生物软件 其它生物软件
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日期:2007-01-26 12:27:15
点击:147 评论:0
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| 软件名称 更新时间 软件等级 下载次数 软件大小 CvtCNKI v2.0.1 2006-12-12 116 570K ■中国期刊网(CNKI)改版后,热心网友为EndNote制作的CNKI过滤器(Filter)大都已失效。CvtCNKI解决了这个问题。 ■CvtCN... 软件类别: 其它生物软件 运行环境:Win9x/Win2000/WinXP |
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生物软件 趣味生物软件
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日期:2007-01-26 12:25:31
点击:138 评论:0
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| 软件名称 更新时间 软件等级 下载次数 软件大小 Life32 V216 2006-2-17 392 1.03M 这是目前运行最快的细胞生命程序,且功能非常多。其实细胞生命模型为一个数学问题,但我对它非常感兴趣。它不仅仅为数学问题,它是一个小宇宙,与我们的世界一样... 软件类别: 趣味生物 |
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生物软件 质谱软件
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日期:2007-01-26 12:23:17
点击:116 评论:0
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| 软件名称 更新时间 软件等级 下载次数 软件大小 pDRAW32 1.1.86 2006-3-30 632 3.01M 是又一个非常方便的质粒绘制工具与DNA分析工具。它包括DNA序列输入与分析、限制酶消化分析以及环形与线性DNA图形输出等许多功能。作者将许多选择设计成... 软件类别: 质谱软件 运行 |
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